L'agence effectue un contrôle général des systèmes informatiques et des réseaux relevant des divers organismes publics et privés , elle est chargée des missions suivantes:

• Veiller à l'exécution des orientations nationales et de la stratégie générale en systèmes de sécurité des systèmes informatiques et des réseaux
• Suivre l'exécution des plans et des programmes relatifs à la sécurité informatique dans le secteur public à l'exception des applications particulières à la défense et à la sécurité nationale et assurer la coordination entre les intervenants dans ce domaine
  
• Assurer la veille technologique dans le domaine de la sécurité informatique
  
• Etablir des normes spécifiques à la sécurité informatique et élaborer des guides techniques en l'objet et procéder à leur publication
  
• Œuvrer pour encourager le développement de solutions nationales dans le domaine de la sécurité informatique et à les promouvoir conformément aux priorités et aux programmes qui seront fixés par l'agence
  
• Participer à la consolidation de la formation et du recyclage dans le domaine de la sécurité informatique
  
• Veiller à l'exécution des réglementations relatives a l'obligation de l'audit périodique de la sécurité des systèmes informatiques et des réseaux